Varian Baru COVID-19, ini yang sudah Diketahui

GENOM Sars-CoV-2 selalu diprediksi akan bermutasi. Bagaimanapun, itulah yang dilakukan virus dan mikroorganisme lainnya. Genom Sars-CoV-2 terakumulasi sekitar satu atau dua mutasi setiap bulan saat bersirkulasi.

Direktur COVID-19 Genomics UK Consortium Sharon Peacock dan timnya mengurutkan varian Sars-CoV-2 yang baru. Ia berbagi apa yang ia ketahui tentang varian baru virus corona dalam tulisannya di Theguardian.com, Rabu (23/12). Mereka terus mencari lebih banyak bukti untuk memahami bagaimana hal itu dapat mengubah pandemi.

"Faktanya, laju perubahannya jauh lebih rendah daripada virus lain yang kita ketahui. Misalnya, influenza musiman bermutasi sedemikian rupa sehingga vaksin baru harus diperkenalkan setiap tahun," jelas profesor mikrobiologi dan kesehatan publik di Universitas Cambridge itu.

BACA JUGA:

Saat 3M Tidak Cukup Bendung Penyebaran COVID-19

Meski begitu, seiring waktu populasi virus akan mengakumulasi cukup banyak mutasi dalam kombinasi yang berbeda. Fitur mencolok dari garis keturunan Sars-CoV-2 1.1.7 yang mereka temukan yang acap disebut 'varian baru' merupakan genom yang memiliki sejumlah besar mutasi jika dibandingkan dengan garis keturunan lain yang diambil di Inggris. Varian itu memiliki total 23. Hal itu yang membedakannya dengan garis keturunan lain.

Menurut Peacock, kebanyakan mutasi tidak mengkhawatirkan karena tidak menyebabkan perubahan pada salah satu asam amino yang menghasilkan protein pembuat virus. Jika terjadi, hal itu patut mendapat perhatian serius, terutama saat mutasi (atau penghapusan) terjadi di wilayah virus yang dapat mengubah cara virus berinteraksi dengan inang manusianya.

Secara khusus, perubahan lonjakan pada protein yang menghiasi bagian luar virus merupakan mekanisme yang digunakannya untuk menempel dan memasuki sel inang, tempat virus dapat bereplikasi. Bagian ini mendapatkan perhatian khusus para ilmuan itu.

Lebih Dapat Ditularkan

"Yang mengkhawatirkan para ilmuwan tentang garis keturunan 1.1.7 ialah, di samping enam mutasi yang tidak mengubah protein apa pun, ada 17 (14 mutasi dan tiga penghapusan) yang mengubahnya," Peacock menekankan.

Analisis genomik awal dari garis keturunan 1.1.7 menunjukkanbeberapa dari mutasi ini telah dijelaskan sebelumnya pada garis keturunan lain dan telah ditemukan untuk mengubah cara virus berperilaku. Satu mutasi (disebut 501Y) telah terbukti meningkatkan seberapa erat protein mengikat reseptor di permukaan sel manusia.

Perubahan kedua (69-70del) telah diidentifikasi pada virus yang berevolusi untuk menghindari respons imun alami pada beberapa pasien yang mengalami gangguan sistem imun. "Tapi tidak ada yang bisa diasumsikan tentang varian baru dan apa arti mutasi ini. Kami membutuhkan lebih banyak bukti ilmiah untuk memahami bagaimana versi virus tertentu ini berperilaku dibandingkan dengan versi lain," tambah Peacock.

Menurut Peacock, hal-hal yang perhatikan antara lain; apakah varian lebih mudah menular di antara orang-orang; apakah itu menyebabkan penyakit yang lebih (atau kurang) parah; dan apakah itu dapat menghindari respons kekebalan tubuh kita.

Saat ini tidak ada bukti bahwa garis keturunan 1.1.7 menyebabkan penyakit yang lebih parah atau menghindari sistem kekebalan. Juga tidak ada alasan untuk berpikir bahwa vaksin yang diluncurkan atau sedang dikembangkan akan kurang efektif melawannya. "Tetapi yang tampaknya semakin mungkin adalah bahwa garis keturunan ini lebih dapat ditularkan," tegas Peacock.

Di Inggris, badan yang mempertimbangkan bukti baru tentang virus tersebut adalah New and Emerging Respiratory Virus Threats Advisory Group (Nervtag). Laporan terakhir yang tersedia untuk umum menunjukkan Nervtag memiliki "keyakinan sedang" bahwa varian baru ini secara substansial lebih dapat ditularkan. Data yang dilihatnya termasuk analisis genom yang menunjukkan bahwa garis keturunan khusus ini tumbuh sekitar 70% lebih cepat.

Masih mungkin ada penjelasan lain untuk penyebaran cepat ini, tetapi gagasan bahwa varian ini lebih dapat ditularkan masuk akal dan tampaknya semakin mungkin. Studi laboratorium yang sedang dilakukan akan menjawab hal ini dengan pasti.

Artinya secara praktis adalah bahwa semua upaya kita untuk mencegah penyebaran - dengan mencuci tangan, memakai masker dan menjaga jarak - menjadi lebih penting. Tidak ada yang menyarankan bahwa variasi baru ini dapat kebal dari usaha-usaha tersebut, selama kita melakukannya dengan benar.

Dari Mana Asalnya

Satu pertanyaan yang mungkin tidak pernah terjawab ialah dari mana varian baru itu berasal. Tempat pertama Peacock dan tim mendeteksinya, dengan melihat kembali sampel virus, ialah di Kent dan London. Namun, belum jelas apakah itu benar-benar muncul di sana. Perlu diingat bahwa Inggris Raya melakukan lebih banyak pengurutan Sars-CoV-2 daripada banyak negara lain, dan fakta bahwa mereka menemukannya di sana berarti sebagai asal mulanya.

"Menariknya, telah disarankan bahwa varian tersebut mungkin muncul pada orang yang imunokomprominya terinfeksi secara kronis, dengan virus yang mampu bereplikasi dan berevolusi di dalamnya dalam jangka waktu yang lama. Tapi, seperti biasa, lebih banyak pekerjaan diperlukan untuk memahami apakah ini masalahnya," jelas Peacock.

Menurut Peacock, untuk saat ini, cara mengidentifikasi mutasi yang mungkin penting bagi kesehatan manusia adalah dengan melacak tingkat penyebaran virus, memantau tingkat keparahan penyakit dengan cermat, dan memiliki sistem yang siap untuk memberi tahu ketika virus telah mampu menghindari kekebalan yang dihasilkan sebelumnya.

Kisah varian baru ini menunjukkan betapa pentingnya pengurutan genom, tetapi menggarisbawahi fakta bahwa hanya ketika data genom dikaitkan dengan informasi epidemiologis dan klinis, hal itu dapat membuat perbedaan dalam mengendalikan penyakit. (Aru)